Частота приведённых ниже возможных побочных эффектов омепразола указана в соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения: очень часто — более 10%; часто — более 1% и менее 10%; нечасто — более 0,1% и менее 1%; редко — более 0,01% и менее 0,1%; очень редко — менее 0,01%, включая отдельные случаи; частота неизвестна — не может быть определена на основании имеющихся данных. Со стороны пищеварительной системы: часто ‒ боль в животе, запор, диарея, вздутие живота, тошнота, рвота; нечасто ‒ повышение активности «печёночных» ферментов; редко ‒ нарушение вкуса, ощущение сухости во рту, стоматит, отсутствие аппетита, кандидоз желудочно-кишечного тракта, микроскопический колит, гепатит (в том числе с желтухой, у пациентов с предшествующим тяжёлым заболеванием печени), образование желудочных гландулярных кист во время длительного лечения (следствие ингибирования секреции соляной кислоты; доброкачественные, обратимые), печёночная недостаточность. Со стороны центральной и периферической нервной системы: часто — головная боль; нечасто — головокружение, вертиго, парестезии, сонливость, бессонница; редко — спутанность сознания (обратимая), возбуждение, агрессивность, депрессия и галлюцинации (преимущественно у больных с тяжёлыми сопутствующими соматическими заболеваниями), энцефалопатия (у больных с предшествующим тяжёлым заболеванием печени). Со стороны опорно-двигательного аппарата: нечасто ‒ перелом бедра, костей запястья, позвонков; редко — артралгия, миалгия; очень редко ‒ мышечная слабость. Со стороны органов кроветворения: редко — лейкопения, тромбоцитопения; очень редко ‒агранулоцитоз, панцитопения. Со стороны мочеполовой системы: редко — гематурия, протеинурия, инфекция мочевых путей. Со стороны эндокринной системы: редко — гинекомастия. Со стороны кожи и подкожных тканей: нечасто — дерматит, зуд, крапивница; редко — алопеция, фотосенсибилизация; очень редко ‒ мультиформная экссудативная эритема, синдром Стивенса-Джонсона, токсический эпидермальный некролиз. Аллергические реакции: редко — лихорадка, ангионевротический отёк, анафилактическая реакция/ шок, бронхоспазм, интерстициальный нефрит. Прочие: нечасто — недомогание; редко — нечёткость зрения, периферические отёки, повышенная потливость, гипонатриемия; частота неизвестна — гипомагниемия (в том числе ассоциированная с гипокалиемией), гипокальциемия вследствие тяжёлой гипомагниемии.